PHENOMIN-ICS

Fiche plateforme

Coordonnées

Email :

Télephone : 03 88 65 56 57

Adresse : PHENOMIN-ICS 1 rue Laurent Fries 67404 ILLKIRCH

Affiliation

ICS - Institut Clinique de la Souris (ICS)

IGBMC - Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC)

Site Internet

http://www.phenomin.fr/fr-fr/

Type d'activité

R&D

Domaine d'activité

Bio-informatique, Imagerie, Pré-clinique, Génétique, Expérimentation animale, Systèmes modèles animaux

Description

PHENOMIN-ICS fournit un ensemble de services spécialisés en génomique fonctionnelle chez la souris et le rat pour la recherche académique et industrielle appliquée à la biomédecine. La génomique fonctionnelle, permet d’étudier le rôle des gènes dans différents processus biologiques, physiologiques et comportementaux. La première approche vise à engendrer, chez le rongeur, les mutations identifiées dans la population humaine, afin de reproduire les signes pathologiques caractéristiques d'une maladie donnée. Ces modèles permettent ainsi de valider l’existence d’un lien de causalité entre ces mutations et la maladie étudiée, de mieux comprendre sa physiopathologie et, in fine, de réaliser des études précliniques, afin de tester de nouvelles approches thérapeutiques. Pour se faire, l’infrastructure propose de créer des souris/rat génétiquement modifiés, à la carte, et d’en fournir une caractérisation phénotypique en utilisant un protocole standardisé ou plus spécifique, selon les objectifs du projet. L’infrastructure offre 37 plateformes de services différents à ses utilisateurs jusqu’à l’archivage des lignées, répartis dans les catégories suivantes : Ingénierie génétique: modèles de souris et de rat génétiquement modifiés, Expériences de validation du modèle de rongeur généré, Caractérisation Zootechnique et Clinique à la pointe de la technologie, en particulier dans les modèles de souris (analyse fonctionnelle couvrant la plupart des fonctions physiologiques, protocole personnalisé ou standardisé) mais aussi les modèles de rats (analyse comportementale et cognition) Archivage et Distribution de lignées de rongeurs, Mise à disposition de Ressources et Formations en génomique fonctionnelle. La seconde approche de la génomique fonctionnelle vise à invalider, de manière systématique, chacun des 23 000 gènes codant des protéines chez la souris pour en déchiffrer les principales fonctions. On parle alors de souris « perte de fonction » ou « knock-out ». Le phénotype de chaque souris déficiente ainsi produite est caractérisé selon un protocole standardisé. Pour venir à bout de ce travail colossal, les acteurs scientifiques de la phénogénomique du monde entier se fédèrent en consortiums depuis 2002. PHENOMIN participe activement à cet effort en étant membre de l’infrastructure européenne de recherche INFRAFRONTIER (https://www.infrafrontier.eu/) et aussi du consortium International de Phenotypage de la souris (IMPC, http://www.mousephenotype.org/), qui pour l’ensemble, contribue à ce projet d’envergure internationale, à savoir, l’annotation fonctionnelle du génome des mammifères. Par ce biais, PHENOMIN développe de nouveaux outils génétiques et de nouveaux modèles de pathologie humaine pour la communauté scientifique Française, et construit une ressource de modèles pour la recherche fondamentale, la biotechnologie et l'innovation biopharmaceutique. PHENOMIN-ICS est impliqué dans différents réseaux et programmes de recherche régionaux, nationaux, européens et internationaux depuis plusieurs années, à la fois pour diffuser ses connaissances scientifiques et pour améliorer continuellement son offre de services. Aujourd’hui PHENOMIN est membre de l'infrastructure nationale de recherche CELPHEDIA (http://www.celphedia.eu/), focalisée sur l’ensemble des animaux modèles utilisés en recherche scientifique et biomédicale.