Analyse intégrative des altérations épigénétiques des tumeurs desmoïdes: étude ancillaire de l'essai clinique national, multicentrique (CRYODESMO-1)

Fiche projet

Année

2020

Appel à projets

Appel à projets « Soutien à l'émergence de projets - Innovation translationnelle » (Cancéropôle Est)

Acronyme

CRYODESMO-1

Resumé

Les tumeurs desmoïdes sont des tumeurs rares dérivant des cellules souches mésenchymateuses. Leur incidence est estimée à environ 300 nouveaux cas par an en France. Bien qu’il s’agit d’une tumeur bénigne, la progression locorégionale peut entrainer des douleurs et des déformations, nécessitant une prise en charge médicale. La pathogénie de ces tumeurs est essentiellement liée à la dérégulation de la voie Wnt. La très grande majorité des tumeurs desmoïdes sont sporadiques et la dérégulation de la voie en rapport avec des mutations du gène CTNNB1. Dans les formes héréditaires de tumeur demoïde, les patients sont atteints de polypose adénomateuse familiale avec les mutations constitutionnelles du gène APC largement décrites.

Parce que ces tumeurs ont une progression clinique imprédictible, les travaux de recherche translationnelle sont utiles pour identifier les biomarqueurs prédictifs de la progression en association avec les paramètres cliniques. A ce jour, la majorité des travaux se sont concentrés à ce jour sur leurs altérations transcriptomiques et sur le rôle de certaines mutations de CTNNB1. En revanche, à notre connaissance, aucune étude n'a analysé le rôle des altérations épigénétiques, notamment la méthylation de l’ADN.

Dans ce travail, nous émettons l’hypothèse que les tumeurs desmoïdes sont caractérisées par des altérations épigénétiques dont l’identification est cruciale pour définir les gènes suppresseurs de tumeurs impliqués dans la pathogénie de ces tumeurs. Pour répondre à cette question, nous allons utiliser des échantillons de tumeur desmoïde collectés prospectivement dans le cadre de l’essai CRYODESMO-1, essai qui évaluait l'efficacité de la cryothérapie. Dans un deuxième temps, nous comptons aussi générer une signature épigénétique associée à la réponse prolongée à la cryothérapie. Ainsi, notre étude va permettre de générer la première cartographie épigénétique des tumeurs desmoïdes.