Nuclear architecture and chromatin structure in genome integrity and DNA repair

Fiche projet

Année

2009

Appel à projets

PLBIO 2009 - Projets libres en Recherches biomédicales (INCa)

Resumé

Les lésions double-brin de l’ADN (DSBs) sont des lésions potentiellement graves qui peuvent affecter l’intégrité du génome. . L’incapacité à réparer ces lésions peut déclencher des translocations tumorigéniques lorsque des brins d’ADN provenant de chromosomes différents sont réunis par erreur. Malgré les avancées ayant permis l’identification de facteurs impliqués dans la réparation de ces cassures, produits de gènes dits suppresseurs de tumeurs, nous avons très peu de données sur la dynamique de leur activité dans un contexte chromatinien ainsi que sur la formation des translocations génomiques in vivo. Nous avons développé un système de marquage chromosomique permettant de visualiser en temps réel dans une cellule vivante le devenir d’une cassure double-brin de l’ADN ayant lieu en un point défini de la matrice nucléaire (Soutoglou et al., Nat. Cell Biol., 2007). Nous avons utilisé ce système modèle pour identifier des facteurs nécessaires à la maintenance de l’alignement des brins d’ADN coupés. Nous avons aussi montré que des lésions DSBs non réparées forment préférentiellement des translocations avec des chromosomes dans un champ proche et que la perte de contraintes de positionnement est corrélée avec une augmentation de l’instabilité génomique. Ces résultats ont apporté une nouvelle perspective sur les propriétés cellulaires des lésions DSBs, suggérant un mode d’action des translocations chromosomiques in vivo où celles-ci s’opèrent entre deux lésions DSBs localisées dans un champ spatial proche. Dans le cadre de ce projet, nous utiliserons une approche pluridisciplinaire combinant imagerie cellulaire in vivo et des techniques de biochimie afin de 1) tester l’importance de l’architecture nucléaire pour la maintenance de l’intégrité génomique et de 2) identifier de nouveaux facteurs impliqués dans les mécanismes de réparation des lésions DSBs et dans l’alignement des brins de chromosomes cassés. [...]