Etude de l'instabilité du génome à travers trois maladies génétiques de la réparation prédisposant aux cancers. (TransReCa)

Fiche projet

Année

2008

Appel à projets

Projets Libres - Recherches Biomédicales, Recherches en Sciences Humaines et Sociales, Recherche en Epidémiologie et Santé Publique (INCa)

Acronyme

TransReCa

Resumé

Contexte scientifique La réparation par excision de nucléotides (NER) lutte contre les effets d'un grand nombre de lésions provenant des rayonnements UV ou de divers dérivés environnementaux. Une absence de cette voie de réparation chez l'homme est à l’origine de trois pathologies: le xeroderma pigmentosum (XP), la trichothiodystrophie (TTD) et le syndrome de Cockayne (CS). Ces maladies associent un ensemble de phénotypes complexes et variés dont l’apparition de cancers de la peau dés les premières années de la vie. L’aetiologie de ces symptômes est encore mal connue. Certains facteurs NER comme TFIIH (muté dans le XP, CS et TTD), CSA et CSB (mutés dans le CS) sont également impliqués dans la transcription des gènes codant pour les protéines. Ceci indique que certains phénotypes, dont les cancers de le peau, pourraient trouver leur origine dans une déficience de l’expression de gènes spécifiques couplés à une déficience de la réparation de lésions de l’ADN. L’objectif de ce projet est de mieux comprendre les défauts moléculaires du XP, CS et TTD afin de préciser la physiopathologie des patients, d’aider à une thérapie mais aussi de mieux comprendre la formation de cancers dans la population normale. En effet, les patients XP sont d’excellents modèles d’étude des cancers de la peau car ils développent des cancers identiques à ceux de la population normale. Nous utiliserons aussi une caractéristique remarquable des patients CS ou TTD qui, bien que ne réparant pas les lésions de l’ADN, ne développent pas de cancers pour des raisons encore inconnues. Comparer ces patients et comprendre ce qui les différencie pourrait s’avérer très important dans la lutte contre le cancer. Descriptif du projet Parce que les études portant sur les maladies génétiques de la réparation ne seront pas seulement utiles pour aider les patients mais plus généralement nous aiderons à mieux comprendre le mécanisme de carcinogènese, nous souhaitons développer plusieurs axes de recherche que nous présenterons sous la forme de trois Workpackages : WP1 : Défauts transcriptionels et protéines CS Nous souhaitons : 1/ Obtenir une connaissance détaillée des défauts transcriptionnels liés à des mutations dans CSA ou CSB. 2/ Déterminer le rôle des protéines CS (CSA et CSB) dans la transcription de gènes spécifiques. 3/ Obtenir un aperçu des défauts transcriptionnels associés à des mutations dans l’helicase XPD de TFIIH dans des cellules XP-D/CS et dans un modèle de souris équivalent. WP2 : De nouvelles avancées dans la compréhension de la NER Une connaissance détaillée du mécanisme d’élimination des lésions est également nécessaire pour comprendre l’apparition des cancers chez les XP. La nature des protéines qui participent à la NER est connue mais la régulation de la NER, et la nature des protéines régulatrices sont les nouveaux défis à relever. Nous voudrions: 4/ Utiliser une stratégie de transfection de banque de siRNA afin d’identifier de nouveaux acteurs de la NER. 5/ Analyser les modifications post-traductionelles des protéines de la NER et leur conséquence sur la NER. WP3 : la relation structure-fonction de protéines de la NER Couplée au reste de l’étude, une étude structure-fonction sera entreprise sur TFIIH et ses partenaires en NER. Ces études de structure-fonction sont nécessaire pour comprendre le rôle de des diverses sous unités de TFIIH, qui en contient 10, en transcription et en réparation. 5/ Des approches structurelles par cristallographie aux rayons X, RMN ou microscopie électronique seront utilisées pour savoir comment des mutations dans l'une ou l'autre des sous-unités XPB et XPD ou p8/TTD-A de TFIIH ont une incidence sur leur interaction avec leurs partenaires au sein du facteur. Résultats attendus Les résultats obtenus à partir de ce projet nous permettrons d’avoir une meilleure vision des dérèglements à l’origine de la physiopathologie des patients XP, CS et TTD. Cette approche nouvelle de l’aetiologie de ces phénotypes nous permettra d’améliorer le quotidien des patients. Ces résultats peuvent également nous permettent de comprendre certains aspects de pathologies touchant la population normale comme le cancer mais aussi le vieillissement, deux problèmes de santé publique. La lutte contre le cancer tirera bénéfice d’une connaissance approfondie des mécanismes affectés chez les patients XP, CS ou TTD. Une partie du projet nous permettra de mieux comprendre le mécanisme NER en se concentrant sur l’étude du facteur TFIIH qui le plus complexe des facteurs impliqués en NER. L’utilisation de technique de transfection de banque de siRNA à l’aide d’automates nous permettra également d’affiner nos connaissances sur les modes de régulation de la NER en identifiant de nouveaux acteurs qui seront des cibles potentielles pour le traitement des patients.