Fiche projet
Année
2008
Appel à projets
Recherche translationnelle du malade vers le laboratoire (INCa)
Acronyme
BIO IFCT-00-02 II
Resumé
Contexte scientifique : Les cancers du poumon non à petites cellules (CBNPC) de stades précoces sont potentiellement accessibles à la chirurgie curative mais présentent une survie à 5 ans inférieure à 50%, du fait de récidive locale mais surtout générale de la maladie. La meilleure stratégie à venir applicable aux stades précoces s’oriente vers une chirurgie associée à une chimiothérapie. L’objectif principal de l’essai clinique IFCT-00-02 est de déterminer quelle est la meilleure séquence de chimiothérapie associée à la chirurgie, pré ou péri-opératoire. Il s’agit d’un essai de phase III pour les stades I et II où sont testés deux bras de chimiothérapie, soit une association cisplatine-gemcitabine, soit une association carboplatine-paclitaxel. Hormis le stade, il n’existe pas à l’heure actuelle pas de facteur pronostique validé dans les CBNPC opérés. Il y a donc tout un champ à explorer, notamment en ce qui concerne les marqueurs moléculaires. De plus, il n’y a pas à l’heure actuelle de marqueurs validés prédictifs de sensibilité aux chimiothérapies. Descriptif du projet : - Ce protocole a inclus 528 patients consécutifs, randomisés, et a été l’occasion de réaliser une banque de tumeurs unique en France, d’une série de patients atteints de CBNPC de stades et de traitements homogènes. Un projet biologique ancillaire de ce protocole clinique appelé BIO-IFCT-00-02 rassemble plusieurs équipes en France (cf. infra). A l’heure actuelle, 250 tumeurs congelées ont été recensées et ces tumeurs prélevées lors du geste chirurgical après chimiothérapie ont été centralisées pour examen anatomo-pathologique et extraction des ADN. Par ailleurs, 475 blocs paraffine correspondant ont également été centralisés. - Nous proposons de réaliser au cours du projet BIO-IFCT-00-02 II, des puces CGH de haute définition (44K) par la technologie Agilent ® sur les tumeurs congelées suffisamment riches en cellules tumorales (50% minimum) et en ADN, soit 150 tumeurs sélectionnées. - Après analyse bio-informatique, les gênes d’intérêt seront validés par PCR quantitative relative en temps réel sur les ADN extraits des blocs paraffines de l’ensemble de la cohorte disponible. Cette analyse se fera par la technologie Syber Green (Roche) sur Light Cycler plaque 480 (Roche). Parallèlement, une analyse systématique de PCR quantitative relative sera réalisée pour les gènes EGFR et MET. - D’autre travaux de caractérisation moléculaire sont en cours pour la recherche des mutations de K-Ras (exon 1), d’EGFR (exons 18 à 21) et de p53 (exons 4 à 8), de méthylations de gènes tels que p16, O6MGMT, DAPK ainsi que d’autres travaux d’immunohistochimie pour EGFR, la beta-tubuline 3, XRCC5, ERCC1, O6MGMT, BRCA1, BRCA2, MET, IGFR1 et IGFR2. Ils verront leurs résultats comparés à notre analyse ADN à haut débit. Résultats attendus : Une analyse statistique comparera les résultats de PCR quantitative relative en temps réel à la survie globale, puis aux taux de réponses à la chimiothérapie, et à survie sans progression. Parallèlement, ces résultats de PCR quantitative relative seront aussi comparés à ceux des recherches de mutations, de méthylation et d’immunohistochimie dans le but de déterminer des groupes de marqueurs biologiques pronostiques des stades précoces de CBNPC et des marqueurs biologiques de chimio-sensibilité/résistance. Une analyse uni-variée puis multivariée des marqueurs biologiques et des données cliniques (âge, sexe, type histologique, stade TNM, type de chirurgie) permettra de définir des sous-groupes de patients au pronostic différent et aux réponses à la chimiothérapie différentes.
Partenaires
Territoire
Alsace
Mots clés
Cancer Bronchique Non à Petites Cellules / stades précoces / chimiothérapie péri-opératoire / puces CGH de haute résolution / PCR quantitative relative en temps réelNon-Small Cell Cung cancer / early stages / perioperative chemotherapy / high resolution DNA CGH micro-array / Real-time quantitative PCR
