Etude des interactions entre oncoprotéines virales et domaines PDZ selon une approche INteractomique QUANTitative : implications pour le cancer (InQuant)

Fiche projet


ANNÉE

2018

Appel à projets

Soutien à l'Emergence de Projets (Cancéropôle Est)

Acronyme

InQuant

Territoire

Alsace

Mots clés

Oncoprotein, Virus, Cancer, Domain-motif interaction network, High-throughput data

Publications


ProFeatMap: a highly customizable tool for 2D feature representation of protein sets.

Bich G, Monsellier E, Travé G, Nominé Y

Bioinform Adv. 2023 03 9;3(1):vbad022

Quantitative fragmentomics allow affinity mapping of interactomes.

Gogl G, Zambo B, Kostmann C, Cousido-Siah A, Morlet B, Durbesson F, Negroni L, Eberling P, Jané P, Nominé Y, Zeke A, Østergaard S, Monsellier É, Vincentelli R, Travé G

Nat Commun. 2022 09 17;13(1):5472

A Computational Protocol to Analyze PDZ/PBM Affinity Data Obtained by High-Throughput Holdup Assay.

Jané P, Chiron L, Bich G, Travé G, Nominé Y

Methods Mol Biol. 2021 ;2256:61-74

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